尿路感染由细菌引起(很少数可由真菌、原虫、细菌直接侵入)，或通过血液感染、上行感染、淋巴感染、直接感染。另外，中老年男性尿路感染增加的主要原因是细菌性前列腺炎和前列腺肥大。一般来说，男性尿路感染是一种“并发疾病，即由于宿主尿路结构和功能异常，内源性菌群导致防御能力减弱。

　　(1)血液感染:血液感染多见于新生儿或金色葡萄球菌败血症患者。血流(如扁桃体炎、鼻窦炎、根尖周炎、结痂等。)被身体感染部位的细菌侵入到达肾脏，先引起肾皮质多发性小脓肿，再沿肾小管扩散，引起肾盂肾炎。

　　(2)上行感染:尿路感染大多是上行感染引起的。正常人膀胱以上的尿路没有细菌生长，后尿道基本无菌，但前尿道有细菌寄生，因为尿道黏膜本身就有抵抗细菌入侵的能力。再加上尿流常洗，一般情况下不容易致病。尿道的寄生细菌大部分来自粪便，女性通常来自阴道分泌物的污染。女性尿道口靠近肛部，尿道短而宽，女性容易向上感染。